Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME1P48163 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ME1P48163 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ME1P48163 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ME1P48163 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME1P48163 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME1P48163 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME1P48163 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms