Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC1P41238 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOBEC1P41238 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms