Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms