Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD34P28906 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD34P28906 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms