Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APCP25054 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APCP25054 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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APCP25054 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APCP25054 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APCP25054 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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