Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EPHA1P21709 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms