Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD53P19397 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD53P19397 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD53P19397 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD53P19397 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms