Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EPCAMP16422 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPCAMP16422 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms