Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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