Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C8orf88P0DMB2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C8orf88P0DMB2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms