Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCG5P05408 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCG5P05408 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCG5P05408 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms