Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms