Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms