Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF3O43395 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms