Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F3O00716 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F3O00716 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
E2F3O00716 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
E2F3O00716 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F3O00716 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms