Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms