Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
IGHV3-16A0A0C4DH30 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IGHV3-16A0A0C4DH30 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms