Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms