Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
POLR1DQ9Y2S0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR1DQ9Y2S0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms