Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBNO2Q9Y2G9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SBNO2Q9Y2G9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms