Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM35Q9UPQ4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms