Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF8Q9UPP1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms