Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TTC7AQ9ULT0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTC7AQ9ULT0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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