Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms