Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBE1Q9UJT0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms