Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP35Q9P2H5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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