Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms