Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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FANCLQ9NW38 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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FANCLQ9NW38 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FANCLQ9NW38 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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