Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC4BQ9NT99 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms