Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPR88Q9GZN0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms