Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMBRA1Q9C0C7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms