Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TDRD1Q9BXT4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms