Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTDSS2Q9BVG9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms