Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF559Q9BR84 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms