Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UHRF1Q96T88 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms