Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRBNQ96SW2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRBNQ96SW2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms