Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCLRE1CQ96SD1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DCLRE1CQ96SD1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms