Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CICQ96RK0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CICQ96RK0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms