Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms