Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC9Q96Q05 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms