Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HHIPL1Q96JK4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HHIPL1Q96JK4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms