Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms