Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms