Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC11Q96DB2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms