Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP13Q92995 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP13Q92995 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP13Q92995 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP13Q92995 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP13Q92995 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP13Q92995 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms