Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GIPC3Q8TF64 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms