Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00301Q8NCQ3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00301Q8NCQ3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms