Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACBD4Q8NC06 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms