Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC89Q8N998 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC89Q8N998 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms