Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC174Q6PII3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms